Markūnai е село во околиската општина Trakai, во округот Вилнушки, Литванија. Markūnai се наоѓа на 157 m надморска височина. Најблискиот голем град е Вилнус, на 37 km источно. Меѓу знаменитостите во околината се Trakai Island Castle (18,0 km), Vilnius Cathedral (37 km) и Basilica of the Visitation of the Blessed Virgin Mary (17,1 km).

Се среќава и како Markūnai.